Obs: Envio esse pois achei a estrutura de ensino muito bem elaborada.
É isso ai, todo o conteúdo da faculdade em vídeo e de graça, bom proveito.
Aulas de Computação Grátis
Essa semana o Ilvo me passou uma dica muito interessante:
Para quem não compreendeu 100% algum conteúdo ou quem queira estudar novamente o conteúdo da faculdade, segue um link muito interessante.
http://www.compcederj.com.br/aulas/
É isso ai, todo o conteúdo da faculdade em vídeo e de graça, bom proveito.
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Dicas de Genexus - Continuação
Continuando as dicas rápidas publicadas em: http://bolivarbutzke.blogspot.com.br/2012/03/dicas-de-genexus.html
20 Como criar um confirm para web em genexus?
Adicione no evento Start da web panel o JS confirm ao botão/variável bitmap de uma grid... exemplo:
&VariavelGrid.JSEvent('onclick',"confirm('Realmente deseja...?')")
21 Add favicon Genexus
Na master page -> Evento Start -> Add: Form.HeaderRawHTML = '<link rel="shortcut icon" href="Imagens/sgp.ico" type="image/x-icon" />'
22 XML inválido ao usar o Fusion Charts?
Verificar se possui algum caracter especial no gráfico, acentos no caption, nos eixos etc, se tiver, remova ou coloque o código html correspondente, muitas vezes é este o problema.
23 Como exportar dados para o Excel usando variável do tipo ExcelDocument?
Exemplos prontos nos links abaixo:
24 Como configurar o Genexus para incluir ou não a tag compatibilidade internet explorer < meta http-equiv="X-UA-Compatible" content="IE=EmulateIE7" > em todas as páginas da aplicação?
Nas propriedades do Gerador (Preferências->Gerador->xxx) tem uma propriedade chamada Internet Explorer Compatibility Mode
Bote ou tire conforme sua vontade e verifique as mudanças em layouts (css, js) no IE.
Se essa meta tag tivesse um "name" dava pra modificar assim: Form.MetaEquiv.RemoveItem('nome')
Obs.: as vezes precisa fazer alguma alteração em transações pra gerar novamente... atualizar de fato.
25 Como trazer um objeto do modo Design para Produção no Genexus 9?
20 Como criar um confirm para web em genexus?
Adicione no evento Start da web panel o JS confirm ao botão/variável bitmap de uma grid... exemplo:
&VariavelGrid.JSEvent('onclick',"confirm('Realmente deseja...?')")
21 Add favicon Genexus
Na master page -> Evento Start -> Add: Form.HeaderRawHTML = '<link rel="shortcut icon" href="Imagens/sgp.ico" type="image/x-icon" />'
22 XML inválido ao usar o Fusion Charts?
Verificar se possui algum caracter especial no gráfico, acentos no caption, nos eixos etc, se tiver, remova ou coloque o código html correspondente, muitas vezes é este o problema.
23 Como exportar dados para o Excel usando variável do tipo ExcelDocument?
Exemplos prontos nos links abaixo:
- http://www.genexando.com/2009/08/excel-no-genexus.html
- http://treinamentodash.blogspot.com.br/2008/05/upload-de-arquivos-e-leitura-de-arquivo.html
24 Como configurar o Genexus para incluir ou não a tag compatibilidade internet explorer < meta http-equiv="X-UA-Compatible" content="IE=EmulateIE7" > em todas as páginas da aplicação?
Nas propriedades do Gerador (Preferências->Gerador->xxx) tem uma propriedade chamada Internet Explorer Compatibility Mode
Bote ou tire conforme sua vontade e verifique as mudanças em layouts (css, js) no IE.
Se essa meta tag tivesse um "name" dava pra modificar assim: Form.MetaEquiv.RemoveItem('nome')
Obs.: as vezes precisa fazer alguma alteração em transações pra gerar novamente... atualizar de fato.
25 Como trazer um objeto do modo Design para Produção no Genexus 9?
- Menu Build->Impact Objects
- Clique Botão Tag All
- Clique botão Copy Tagged
- Feito.
Qualidade / PGQP - Cursos Grátis SEBRAE / FNQ
Essa semana fiz um curso online, grátis, e gostei bastante. O conteúdo é bem organizado e as informações são muito importantes para melhorar nossas empresas.
Além deste curso, Primeiros Passos para a Excelência, que recomendo fortemente a todos os gestores de mepresas, existem outros cursos relacionados a PGQP, acesse http://fnq.org.br/site/458/default.aspx
Link do próximo curso que estarei fazendo, site do PGQP: http://www.mbc.org.br/mbc/pgqp/hot_sites/sa2011/index.php?pagina=capacitacao_sensibilizacao&Itemid=437
Além deste curso, Primeiros Passos para a Excelência, que recomendo fortemente a todos os gestores de mepresas, existem outros cursos relacionados a PGQP, acesse http://fnq.org.br/site/458/default.aspx
Link do próximo curso que estarei fazendo, site do PGQP: http://www.mbc.org.br/mbc/pgqp/hot_sites/sa2011/index.php?pagina=capacitacao_sensibilizacao&Itemid=437
Otimização e Desenvolvimento de Ferramentas para BioInformática: Pipelines Metagenômicos, com Raquel Dias
13º Fórum de Informática SETREM - Anotações da segunda noite, trabalho de mestrado de Raquel Dias.
Atividades de um "Informata" na Biologia.
Raquel é formada em Biologia e está fazendo mestrado em Computação.
Laboratório de Alto Desempenho - PUCRS
Raquel.dias.001@acad.pucrs.br
www.lad.pucrs.br
Otimizações quantitativas
Processamento paralelo e distribuído
Otimização qualitativa
- altera a estratégia para encontrar uma solução
APLICAÇÕES DE TI NA BIOLOGIA
Genética
- Bases de dados (NCBI, GenBank)
- Pós-Processamento Genômico
- Pós-processamento metagenômico
- Análise filogenética
- Simulações evolutivas
Bioquímica
- Bando de dados de proteínas (PDB)
- Modelagem molecular
- Visualização de proteínas
- Dinâmica molecular (reações enzimáticas)
ÁREA DO TRABALHO DE MESTRADO DA RAQUEL
Metagenômica
- Sequenciamento genético
- Abordagens
- Metatranscriptônicas
- Sequenciamento baseado no gene 16S
Inicialmente são coletadas amostras ambientais, após estas amostras passam por um sequenciador (hardware - verifica pelo PH da amostra em um solvente - pega letra por letra) que gera um TXT com os dados genéticos.
Após o sequenciamento é necessário a análise dos dados genéticos para descobrir de que organismos são as sequencias genéticas encontradas, para isso utiliza-se bases de dados como NCBI.
Também é feito uma análise filogenética verificando mutações e comparando com outros organismos da mesma amostra etc.
Illumina: Sequenciamento em larga escala
Como melhorar estas etapas necessárias para analisar os dados genéticos?
- Dados de entrada: bases nucleotídicas, várias amostras.
- Pós-processamento metagenômico.
- Pipelines metagenômicos: Mothur, RDP, Galaxy, MEGAN, RAST, PANGEA.
- Versões offline são de código-aberto, PANGEA é um dos mais completos, por isso foi escolhido para o trabalho.
- Linguagem PERL é ótima para trabalhar com strings/textos, então foi escolhida para manipulação das sequencias genéticas.
- C foi escolhido para cálculos, processamentos.
- Java para visualização dos dados.
Etapas - fases de processamento
1. Entrada de dados
1.1 Filtro de qualidade das sequencias genéticas
2. Métodos de Classificação de Espécies utilizados paralelamente para chegar ao resultado:
- BLAST
- RDP
- SOAP2
3. Comparação dos resultados encontrados pelos 3 métodos para chegar a consenso.
4. Pós-processamento: análise e resumo dos resultados para apresentação ao usuário.
Otimizações execução
- Paralelização do algoritmo BLAST que é o mais demorado e completo, distribui a execução em várias máquinas/processadores.
Melhorias
- Resultados exibidos de forma mais clara, com mais dados, náo apenas o código do banco de dados.
Resultados
- 500x mais rápido a execução
- 125x mais rápido leitura dados NCBI
- Aumentou o nível de certeza dos resultados
Atividades pendentes
- publicação: BMC Bioinformatics
Exemplo apresentado: GenomaQuest - online, modificação do PANGEA.
Raquel é formada em Biologia e está fazendo mestrado em Computação.
Laboratório de Alto Desempenho - PUCRS
Raquel.dias.001@acad.pucrs.br
www.lad.pucrs.br
Otimizações quantitativas
Processamento paralelo e distribuído
Otimização qualitativa
- altera a estratégia para encontrar uma solução
APLICAÇÕES DE TI NA BIOLOGIA
Genética
- Bases de dados (NCBI, GenBank)
- Pós-Processamento Genômico
- Pós-processamento metagenômico
- Análise filogenética
- Simulações evolutivas
Bioquímica
- Bando de dados de proteínas (PDB)
- Modelagem molecular
- Visualização de proteínas
- Dinâmica molecular (reações enzimáticas)
ÁREA DO TRABALHO DE MESTRADO DA RAQUEL
Metagenômica
- Sequenciamento genético
- Abordagens
- Metatranscriptônicas
- Sequenciamento baseado no gene 16S
Inicialmente são coletadas amostras ambientais, após estas amostras passam por um sequenciador (hardware - verifica pelo PH da amostra em um solvente - pega letra por letra) que gera um TXT com os dados genéticos.
Após o sequenciamento é necessário a análise dos dados genéticos para descobrir de que organismos são as sequencias genéticas encontradas, para isso utiliza-se bases de dados como NCBI.
Também é feito uma análise filogenética verificando mutações e comparando com outros organismos da mesma amostra etc.
Illumina: Sequenciamento em larga escala
Como melhorar estas etapas necessárias para analisar os dados genéticos?
- Dados de entrada: bases nucleotídicas, várias amostras.
- Pós-processamento metagenômico.
- Pipelines metagenômicos: Mothur, RDP, Galaxy, MEGAN, RAST, PANGEA.
- Versões offline são de código-aberto, PANGEA é um dos mais completos, por isso foi escolhido para o trabalho.
- Linguagem PERL é ótima para trabalhar com strings/textos, então foi escolhida para manipulação das sequencias genéticas.
- C foi escolhido para cálculos, processamentos.
- Java para visualização dos dados.
Etapas - fases de processamento
1. Entrada de dados
1.1 Filtro de qualidade das sequencias genéticas
2. Métodos de Classificação de Espécies utilizados paralelamente para chegar ao resultado:
- BLAST
- RDP
- SOAP2
3. Comparação dos resultados encontrados pelos 3 métodos para chegar a consenso.
4. Pós-processamento: análise e resumo dos resultados para apresentação ao usuário.
Otimizações execução
- Paralelização do algoritmo BLAST que é o mais demorado e completo, distribui a execução em várias máquinas/processadores.
Melhorias
- Resultados exibidos de forma mais clara, com mais dados, náo apenas o código do banco de dados.
Resultados
- 500x mais rápido a execução
- 125x mais rápido leitura dados NCBI
- Aumentou o nível de certeza dos resultados
Atividades pendentes
- publicação: BMC Bioinformatics
Exemplo apresentado: GenomaQuest - online, modificação do PANGEA.
Interoperabilidade Windows Linux, com André Rushel
13º Fórum de Informática - Anotações da primeira noite.
A abertura da noite foi feita por Fábio Hara, de forma remota, comentando sobre o trabalho do André Rushel.
André é, atualmente, MVP, Most Valuable Professional da Microsoft, palestrou nesta noite sobre ‘Interoperabilidade de Servidores: Microsoft e o Mundo OpenSource’.
Seguem anotações:
[Atualização - 2012-07-06]
Hoje recebi um e-mail da Microsoft com o certificado pela participação deste evento, legal.
A abertura da noite foi feita por Fábio Hara, de forma remota, comentando sobre o trabalho do André Rushel.
André é, atualmente, MVP, Most Valuable Professional da Microsoft, palestrou nesta noite sobre ‘Interoperabilidade de Servidores: Microsoft e o Mundo OpenSource’.
Seguem anotações:
- http://www.microsoftvirtualacademy.com - Muitos treinamentos grátis, dica do Fábio.
- http://lwn.net/ - Software livre, notícias etc.
- Debian-Interix.net - Tem a ver com o SUA, não sei quem copiou de quem.
- http://suacommunity.com/ - SUA, Linux no Windows, comandos etc.
- VDI - Virtual Desktop Infrastructure
- MDT - Microsoft Deployment Toolkit -> Migrar Windows XP para 7 por exemplo, instala drivers, copia arquivos, ingressa no mesmo domínio etc. Grátis.
- MAP - Utilizado para fazer inventário hardware via rede, gera um arquivo XLS, grátis, para windows w linux.
- ACT - Application Compability Toolkit, colocar aplicações para rodar em modo de compatibilidade, permissão de administrador... tutorial do ACT.
- Seamless (RDP?) - utilizado para acessar apenas determinada aplicação remotamente, sem precisar acessar toda a área de trabalho, roda em Windows/Linux.
- Hyper-V 3
- Live Migration (SMB 3.0): muito bom, tem um vídeo da migração de um servidor de uma máquina para outra sem parar os serviços.
- Replication - fazer cópia de uma máquina virtual...
- SysInternals - ferramentas top grátis, de um russo...
- Disk2vhd - transforma máquina física para virtual
- ZoomIt - ferramenta para dar zoom...
- AviCode - verifica erros desenvolvimento
- Windows To Go - Windows no pendrive, postagem do André.
- Programa MSP - Estudantes - Microsoft Student Partners
- Problemas: Não tem Azure no Brasil? Sistemas lentos? tem que verificar. Citrix é melhor? parece que sim, mas bem mais caro também.
[Atualização - 2012-07-06]
Hoje recebi um e-mail da Microsoft com o certificado pela participação deste evento, legal.
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